More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5173 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  67.23 
 
 		 238 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  65.95 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  64.98 
 
 		 251 aa  318  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  66.95 
 
 		 240 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  65.68 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  65.67 
 
 		 253 aa  314  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  65.81 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  64.1 
 
 		 244 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  64.83 
 
 		 244 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  64.83 
 
 		 244 aa  310  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  64.56 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  64.71 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  64.81 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  64.1 
 
 		 240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  64.5 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  63.64 
 
 		 234 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  60.76 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  63.64 
 
 		 234 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  64.5 
 
 		 235 aa  299  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  62.23 
 
 		 245 aa  298  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  61.37 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  64.94 
 
 		 236 aa  294  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  60.78 
 
 		 235 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  61.04 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  58.19 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  64.22 
 
 		 236 aa  288  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  62.34 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  59.74 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  60.43 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  59.48 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  58.65 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  62.78 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  58.26 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  63.64 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  63.44 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  53.65 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  52.38 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  52.81 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  51.52 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  50.65 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  49.78 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  50.66 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  47.84 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.66 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  47.39 
 
 		 233 aa  231  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  45.96 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  45.45 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  47.19 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  44.16 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  45.22 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  46.19 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  44.98 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.67 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.03 
 
 		 604 aa  202  5e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 		 286 aa  201  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 345 aa  199  3e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  46.88 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.11 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  42.67 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  45.45 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.17 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  40 
 
 		 300 aa  193  2e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.69 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  46.4 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  47.51 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.84 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  46.45 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  43.95 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.49 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.11 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.59 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  45.74 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  44.93 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  44.84 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  41.48 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.81 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.45 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  46.19 
 
 		 293 aa  187  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  47.88 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>