More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0021 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 345 aa  695    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  80.89 
 
 		 604 aa  504  9.999999999999999e-143  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  48.8 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  45.26 
 
 		 244 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  43.67 
 
 		 236 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  45.92 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  47.64 
 
 		 232 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.21 
 
 		 233 aa  228  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  44.83 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  45.06 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf119  ABC transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 		 299 aa  227  3e-58  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 		 248 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  45.92 
 
 		 236 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  42.19 
 
 		 239 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  42.49 
 
 		 236 aa  222  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  42.13 
 
 		 236 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  43.04 
 
 		 235 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  42.92 
 
 		 233 aa  216  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  43.61 
 
 		 241 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  42.49 
 
 		 244 aa  215  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 240 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  41.1 
 
 		 244 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  43.48 
 
 		 236 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 244 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  40.34 
 
 		 238 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  44.64 
 
 		 232 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 233 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 233 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  42.06 
 
 		 251 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  42.06 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  42.67 
 
 		 233 aa  212  9e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  43.53 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  41.28 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  39.48 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.95 
 
 		 233 aa  209  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  41.18 
 
 		 245 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  41.63 
 
 		 233 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  40.34 
 
 		 238 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  40.68 
 
 		 236 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 235 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  40.83 
 
 		 245 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 234 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  40.52 
 
 		 245 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  42.79 
 
 		 250 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  40.34 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 235 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  43.1 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  39.48 
 
 		 253 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 245 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  42.49 
 
 		 235 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  42.55 
 
 		 234 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 235 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  42.55 
 
 		 234 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  41.63 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  43.67 
 
 		 241 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.61 
 
 		 230 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  43.78 
 
 		 232 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  45.45 
 
 		 662 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.55 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 246 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  40.97 
 
 		 235 aa  195  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 252 aa  195  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.69 
 
 		 230 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  41.44 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  39.57 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 279 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  39.06 
 
 		 243 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.4 
 
 		 234 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.79 
 
 		 237 aa  192  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  39.57 
 
 		 258 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  43.38 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 253 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  42.86 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  42.98 
 
 		 779 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 235 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  46.64 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  44.8 
 
 		 653 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  43.06 
 
 		 234 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 		 240 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  43.86 
 
 		 238 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  40.09 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.64 
 
 		 644 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.64 
 
 		 888 aa  189  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  41.52 
 
 		 230 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  41.89 
 
 		 230 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.24 
 
 		 664 aa  189  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.72 
 
 		 280 aa  189  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  39.82 
 
 		 235 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  37.77 
 
 		 232 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  44.29 
 
 		 241 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>