More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2035 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 219 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  68.81 
 
 		 225 aa  284  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  71.09 
 
 		 215 aa  278  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  68.25 
 
 		 217 aa  275  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  65.73 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  68.4 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  68.52 
 
 		 225 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  64.65 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  60.99 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  66.36 
 
 		 231 aa  246  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  60 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  58.22 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  56.94 
 
 		 245 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  53.6 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  56.72 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  49.77 
 
 		 238 aa  194  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  50.52 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 643 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  49.22 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  49.53 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.06 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  44.34 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.83 
 
 		 245 aa  181  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  47.26 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  42.13 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.98 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.93 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.98 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  44.86 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.05 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  44.91 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  51.35 
 
 		 242 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  43.52 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  43.93 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.51 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.72 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  42.25 
 
 		 256 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  44.44 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  50.47 
 
 		 236 aa  175  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  44.78 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  46.27 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  48.7 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  174  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.05 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.05 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1273  ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 229 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  43.52 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  42.45 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  39.07 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  39.07 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  43.06 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.98 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  46.45 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.03 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  42.59 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.15 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  48.8 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  45.79 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.41 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  42.79 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.12 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  52.63 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  44.23 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  42.52 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  44.23 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  42.59 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  44.23 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  43.72 
 
 		 251 aa  171  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.44 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  44.13 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.06 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.15 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.09 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  46.48 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.35 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  46.45 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.93 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>