More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2109 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  96.46 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2413  ABC transporter, ATP-binding protein  76.04 
 
 		 221 aa  315  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  56.11 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  49.77 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 221 aa  224  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  52.75 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  48.64 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.56 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  52.05 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  55.39 
 
 		 231 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  52.47 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  52.27 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.9 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  52.47 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  49.1 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  47.03 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  47.03 
 
 		 229 aa  214  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  51.6 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  53 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  48.43 
 
 		 715 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  55.5 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  52.61 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  50.69 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 		 237 aa  211  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.33 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  48.86 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  52.22 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  54 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  52 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.18 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.27 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  51.47 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  55 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  53.43 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  55 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  50.68 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  50.25 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  50.49 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.11 
 
 		 238 aa  208  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  50.95 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  48.17 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  51.5 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  51.5 
 
 		 249 aa  207  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  51.5 
 
 		 249 aa  207  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  50 
 
 		 656 aa  207  8e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 		 658 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  49.32 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  48.65 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  48.88 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  50 
 
 		 657 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.19 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.53 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  47.27 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  49.5 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  49.77 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  51.64 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  49.11 
 
 		 657 aa  204  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.79 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 248 aa  203  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 238 aa  203  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  47 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  51.17 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.84 
 
 		 239 aa  202  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  52.45 
 
 		 251 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.89 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.09 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  52.11 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  49.54 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  49 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  49.11 
 
 		 657 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  49.32 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  46.88 
 
 		 653 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 227 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  51 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  50.49 
 
 		 240 aa  201  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  47.25 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.84 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  50.24 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  48.17 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  50.68 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  48.84 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  47.06 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  48.84 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  48.84 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>