More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2413 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2413  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  76.04 
 
 		 226 aa  341  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  76.04 
 
 		 226 aa  327  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  52.27 
 
 		 233 aa  235  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  50.91 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  50.23 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  50.23 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  50.23 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  48.39 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.95 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  49.77 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  49.77 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  49.77 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  51.14 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  55.56 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  53.64 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  53.64 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  53.18 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.88 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  54.85 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  47.75 
 
 		 715 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  55.07 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  55.07 
 
 		 260 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  53.46 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  47.22 
 
 		 227 aa  211  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  50.67 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  48.85 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  49.31 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  48.61 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  47.03 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.61 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  48.62 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  49.55 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  48.85 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  46.76 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.13 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  54.15 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  49.31 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  50 
 
 		 653 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  53.92 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  49.09 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  47.22 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  48.13 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  49.09 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  51.61 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  51.83 
 
 		 251 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  52.04 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.73 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.95 
 
 		 653 aa  205  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  53.18 
 
 		 287 aa  204  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.95 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  54.09 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  46.12 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  52.04 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  45.21 
 
 		 642 aa  203  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  53.43 
 
 		 246 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.58 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  51.96 
 
 		 247 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  48.85 
 
 		 658 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  50.73 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  51.39 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  45.41 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 408 aa  202  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  46.08 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  48.65 
 
 		 707 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  51.17 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  48.39 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  46.61 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  50.91 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  51.12 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  47.75 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  49.77 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.33 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  52.7 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>