More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3555 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  51.58 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.14 
 
 
239 aa  228  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  50.23 
 
 
249 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  49.55 
 
 
234 aa  223  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.23 
 
 
234 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.23 
 
 
234 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  49.1 
 
 
235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  49.55 
 
 
249 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.75 
 
 
242 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.18 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.82 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.25 
 
 
237 aa  215  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.79 
 
 
230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48.17 
 
 
241 aa  214  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47.73 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.09 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.91 
 
 
247 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  46.79 
 
 
250 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.3 
 
 
266 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  48.87 
 
 
232 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.53 
 
 
228 aa  210  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  50 
 
 
221 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.82 
 
 
226 aa  209  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  48.42 
 
 
232 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
319 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.85 
 
 
224 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.95 
 
 
237 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
286 aa  209  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  47.11 
 
 
225 aa  209  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
240 aa  208  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
248 aa  208  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.36 
 
 
242 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
220 aa  208  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
229 aa  208  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  49.08 
 
 
255 aa  207  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
221 aa  207  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
222 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
252 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.45 
 
 
236 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
226 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.7 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 
233 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.25 
 
 
239 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
248 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.33 
 
 
244 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  47.44 
 
 
228 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.4 
 
 
234 aa  205  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.3 
 
 
652 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
235 aa  205  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  44.09 
 
 
227 aa  205  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  46.36 
 
 
241 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.22 
 
 
227 aa  204  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 
226 aa  205  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 
226 aa  204  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.75 
 
 
653 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  46.22 
 
 
253 aa  204  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  46.15 
 
 
244 aa  204  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  45.33 
 
 
249 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.06 
 
 
232 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 
226 aa  203  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  46.33 
 
 
233 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.5 
 
 
240 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  48.42 
 
 
244 aa  203  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.3 
 
 
228 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.5 
 
 
240 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.06 
 
 
248 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
233 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.06 
 
 
248 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  46.15 
 
 
249 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 
228 aa  202  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
232 aa  202  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.69 
 
 
240 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.3 
 
 
244 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  50.71 
 
 
233 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  45.78 
 
 
237 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 
253 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  48.42 
 
 
253 aa  202  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  45.95 
 
 
253 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 
220 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.93 
 
 
228 aa  201  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  49.32 
 
 
233 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.5 
 
 
232 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  43.69 
 
 
249 aa  202  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
227 aa  201  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.5 
 
 
237 aa  201  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.27 
 
 
225 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
238 aa  201  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.5 
 
 
260 aa  201  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>