More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2670 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  80.8 
 
 		 227 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  71.56 
 
 		 255 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  71.76 
 
 		 217 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  74.65 
 
 		 217 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  70.61 
 
 		 230 aa  297  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 		 229 aa  291  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 		 222 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  61.75 
 
 		 222 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  60.18 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.45 
 
 		 218 aa  261  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  57.6 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 221 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  61.09 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  61.09 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  58.45 
 
 		 218 aa  248  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  58.33 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  60.27 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  58.8 
 
 		 217 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  58.88 
 
 		 221 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  58.72 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  53.7 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  43.42 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  43.42 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  43.42 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  44.04 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  46.15 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  44.14 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.74 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  43.06 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  44.95 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.16 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  43.56 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  46.01 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  43.38 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  45.87 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  43.38 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  43.6 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  43.6 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  44.55 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  43.13 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  45.5 
 
 		 455 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.59 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  41.3 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  41.63 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  42.47 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.86 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  48.4 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  45.33 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  43.91 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  46.73 
 
 		 202 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  42.4 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  41.94 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  39.45 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  45.95 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  41.94 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  42.92 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 643 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  45.95 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.28 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  42.15 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  44.81 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  43.69 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  44.29 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  44.5 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  40.28 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  42.06 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  38.71 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.23 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  46.12 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  39.64 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  41.01 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.71 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>