More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5007 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  88.93 
 
 		 245 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  81.31 
 
 		 238 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  66.82 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  61.5 
 
 		 217 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  60 
 
 		 225 aa  234  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  60.56 
 
 		 215 aa  224  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  60.75 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  60.51 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  57.55 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  58.22 
 
 		 219 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  58.62 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  56.5 
 
 		 231 aa  214  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  56.74 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  52.25 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 277 aa  197  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 242 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 229 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  48.83 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  48.83 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.32 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  47.44 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.64 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  49.26 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  49.26 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  48.62 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  47.25 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.61 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.06 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.47 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.78 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  46.03 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.01 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  47.81 
 
 		 253 aa  188  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  45.97 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  48.17 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  46.46 
 
 		 707 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  47.25 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  51.83 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.28 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  47.93 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  52.09 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  47.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  47.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  42.66 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  39.91 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  47.44 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  39.91 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  49.52 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.09 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.27 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  48.57 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.65 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  45.37 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  46.05 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.03 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  49.77 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  47.27 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  43.46 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.58 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  43.4 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  45.85 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  43.98 
 
 		 220 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.79 
 
 		 242 aa  178  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  45.87 
 
 		 228 aa  178  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 240 aa  178  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>