More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0655 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  99.55 
 
 		 238 aa  447  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 224 aa  448  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  53.69 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  49.26 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  49.76 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  49.26 
 
 		 245 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  48.86 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  51.15 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  49.55 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  49.09 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  48.85 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  43.54 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  49.54 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  45.69 
 
 		 715 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  47.35 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  43.06 
 
 		 256 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  44.7 
 
 		 228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45.02 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  50.45 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  47.69 
 
 		 272 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  50.5 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  48.87 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  43.84 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  41.15 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  43.78 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  42.79 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 256 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  45.77 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  41.59 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  43.78 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.77 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 256 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  44.86 
 
 		 256 aa  177  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 256 aa  177  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  39.19 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  38.71 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  46.04 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  38.03 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.59 
 
 		 233 aa  174  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.07 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  46.19 
 
 		 666 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  44.1 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  44.23 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.6 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.65 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  39.7 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  40.74 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2702  ABC transporter related  41.71 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.09 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.21 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2646  ABC transporter related  41.71 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4104  ABC transporter related  42.65 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0242374 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.01 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.01 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.57 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4557  ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124058  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  45.69 
 
 		 242 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  40.09 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  45.69 
 
 		 250 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4950  bacitracin export ATP-binding protein BceA  40.53 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.38 
 
 		 646 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.31 
 
 		 648 aa  171  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  41.54 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.28 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4964  bacitracin export ATP-binding protein BceA  39.47 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.29 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  39.09 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.28 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.19 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  44.68 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.83 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>