More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0895 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  68.84 
 
 
245 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  66.82 
 
 
243 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  67.12 
 
 
238 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  57.87 
 
 
217 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  53.21 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 
219 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  58.62 
 
 
225 aa  215  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  56.57 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  55.35 
 
 
215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  54.63 
 
 
214 aa  211  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  55.66 
 
 
231 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  50.92 
 
 
235 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  52.51 
 
 
225 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  48 
 
 
238 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  49.76 
 
 
238 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  46.79 
 
 
235 aa  195  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 
224 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  48.11 
 
 
229 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1273  ABC transporter, ATPase subunit  49.14 
 
 
229 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 
229 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  44.39 
 
 
229 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.79 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  47.32 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.86 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.84 
 
 
232 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  45.98 
 
 
247 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.91 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  52.6 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.05 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  44.08 
 
 
233 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  45 
 
 
248 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.44 
 
 
232 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
242 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  46.67 
 
 
224 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.53 
 
 
237 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  49.31 
 
 
243 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  44.55 
 
 
238 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.98 
 
 
232 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  45.41 
 
 
233 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.85 
 
 
239 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 
235 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  39.65 
 
 
266 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
234 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  41.59 
 
 
220 aa  178  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  43.58 
 
 
256 aa  177  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  45.54 
 
 
277 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
255 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
277 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  43.44 
 
 
259 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.75 
 
 
264 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
229 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  45.12 
 
 
233 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  38.01 
 
 
238 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 
235 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  43.64 
 
 
239 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  45.54 
 
 
235 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  41.44 
 
 
228 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  46.76 
 
 
272 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  46.15 
 
 
229 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  43.89 
 
 
226 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  42.48 
 
 
258 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 
228 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  44.29 
 
 
234 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  43.42 
 
 
234 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  43.5 
 
 
229 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  44.13 
 
 
258 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 
224 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  39.3 
 
 
240 aa  176  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
222 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  44.95 
 
 
231 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  42.92 
 
 
259 aa  175  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 
230 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.89 
 
 
232 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  44.44 
 
 
255 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  41.28 
 
 
247 aa  175  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
233 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  40.54 
 
 
230 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  45.7 
 
 
258 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  44.81 
 
 
253 aa  175  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  45.24 
 
 
224 aa  175  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.95 
 
 
228 aa  174  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.59 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  43.13 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  44.29 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  45.49 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  40.95 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  46.57 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  43.69 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  46.12 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  45.07 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  43.44 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.13 
 
 
648 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.67 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  44.24 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>