More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2458 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  96.85 
 
 		 225 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  79.07 
 
 		 235 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  77.13 
 
 		 238 aa  315  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  76.06 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  74.88 
 
 		 217 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  76.78 
 
 		 215 aa  298  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  77.36 
 
 		 214 aa  297  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  68.81 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  64.35 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  60.38 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  60.58 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  59.9 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  53.21 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  51.1 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  49.55 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  48.34 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.07 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.07 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  46.98 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  39.37 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  53 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  47.66 
 
 		 258 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  46.01 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.78 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.25 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  49.74 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 643 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  49.74 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  47.53 
 
 		 280 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 318 aa  177  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  47.45 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  52.36 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  46.95 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.59 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  51.3 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  49.15 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.23 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  49.15 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  45.67 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  45.62 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.36 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  50 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.54 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 254 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.28 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.37 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  48.37 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.37 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.37 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.37 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.37 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.37 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  48.37 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.51 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.37 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.51 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.51 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.51 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  43.93 
 
 		 235 aa  174  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  49.54 
 
 		 271 aa  174  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  49.75 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  51.42 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  45.16 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.37 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  48.33 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.72 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.51 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  45.67 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  43.48 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  46.63 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  45.54 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  43.26 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  44.81 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  46.61 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  51.24 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  49.74 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.81 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>