More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7376 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  100 
 
 		 280 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  70.22 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  64.49 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  63.59 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  60.37 
 
 		 225 aa  251  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  62.04 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60 
 
 		 241 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.36 
 
 		 259 aa  241  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  55.3 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.51 
 
 		 238 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.54 
 
 		 242 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  58.41 
 
 		 228 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.87 
 
 		 227 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  53.71 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.84 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  56.44 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  54.63 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  59.22 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  55.81 
 
 		 226 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  55.11 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 240 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 240 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  50.23 
 
 		 244 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 242 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.32 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.32 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  48.42 
 
 		 228 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 252 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 230 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  46 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  47.73 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  48.39 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  48.62 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 237 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  47.69 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  45.29 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  43.64 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.76 
 
 		 225 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 225 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.45 
 
 		 242 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  46.15 
 
 		 226 aa  182  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  46.78 
 
 		 250 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  39.82 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.34 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 		 234 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.5 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  44.5 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 		 234 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  50.92 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 		 234 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1941  ABC transporter related  50.97 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.76 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.78 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  50.97 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1918  ABC transporter related  50.97 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  44.76 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  42.73 
 
 		 227 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  44.55 
 
 		 223 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  43.18 
 
 		 227 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  43.3 
 
 		 225 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  41.1 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  47.53 
 
 		 225 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  46.82 
 
 		 224 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  43.35 
 
 		 238 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  49.03 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  42.08 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>