More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0526 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  61.64 
 
 
225 aa  261  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  61.47 
 
 
228 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  63.8 
 
 
242 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  59.63 
 
 
228 aa  251  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.45 
 
 
227 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  60.17 
 
 
238 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  55.5 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  54.46 
 
 
238 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  54.82 
 
 
228 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  53.71 
 
 
280 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  57.47 
 
 
226 aa  228  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  52.75 
 
 
258 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  52.42 
 
 
305 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.17 
 
 
280 aa  216  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  54.82 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  54.75 
 
 
289 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.23 
 
 
241 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.89 
 
 
259 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.09 
 
 
357 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.28 
 
 
242 aa  195  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  50.43 
 
 
258 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.63 
 
 
225 aa  191  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.63 
 
 
225 aa  191  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.34 
 
 
231 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
312 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.89 
 
 
221 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  48.05 
 
 
247 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4160  ABC transporter related  53.33 
 
 
229 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  42.04 
 
 
227 aa  185  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  40.44 
 
 
238 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  44.25 
 
 
230 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.34 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  49.76 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.52 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  41.36 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.58 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  46.7 
 
 
256 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  41.56 
 
 
248 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  44.92 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.29 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  41.59 
 
 
227 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.39 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.29 
 
 
249 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
224 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.5 
 
 
264 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
227 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.93 
 
 
238 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  47.44 
 
 
258 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
230 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
224 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  40.91 
 
 
226 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.64 
 
 
230 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.18 
 
 
255 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
277 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  46.02 
 
 
244 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.5 
 
 
225 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  53.11 
 
 
224 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.59 
 
 
239 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.26 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.06 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.26 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.26 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  47.57 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
219 aa  179  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.98 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.26 
 
 
252 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
224 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.26 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  50.49 
 
 
244 aa  178  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.16 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  40.97 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.16 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.83 
 
 
252 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.98 
 
 
242 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.23 
 
 
280 aa  178  8e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
224 aa  178  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  40.91 
 
 
217 aa  177  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  48.57 
 
 
237 aa  177  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  40.36 
 
 
225 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  49.04 
 
 
255 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.04 
 
 
233 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.98 
 
 
249 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.43 
 
 
231 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.17 
 
 
239 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.65 
 
 
201 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  45.97 
 
 
252 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  49.28 
 
 
252 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.14 
 
 
230 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.16 
 
 
236 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  45.98 
 
 
240 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>