More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4160 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4160  ABC transporter related  100 
 
 
229 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  58.59 
 
 
228 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0380  ABC transporter related protein  74.21 
 
 
243 aa  250  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  60.09 
 
 
238 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  60 
 
 
228 aa  245  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  58.41 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.27 
 
 
227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  53.92 
 
 
225 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  53.99 
 
 
238 aa  218  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  57.34 
 
 
226 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  53.33 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  49.1 
 
 
258 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  46 
 
 
231 aa  204  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  51.61 
 
 
280 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  54.21 
 
 
228 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.25 
 
 
225 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.25 
 
 
225 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.12 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.68 
 
 
280 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  55 
 
 
245 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  54.59 
 
 
233 aa  194  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  51.87 
 
 
242 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  43.38 
 
 
242 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
226 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.97 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
226 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
226 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
226 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
226 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.3 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.5 
 
 
357 aa  188  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  50.24 
 
 
305 aa  188  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  44.55 
 
 
226 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  41.2 
 
 
217 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 
235 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  53.18 
 
 
238 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  50.73 
 
 
250 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  50.71 
 
 
248 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.91 
 
 
242 aa  185  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  50.91 
 
 
243 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  43.64 
 
 
230 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  43.05 
 
 
239 aa  184  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.36 
 
 
233 aa  184  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.39 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.05 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.18 
 
 
238 aa  181  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  50.91 
 
 
245 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.64 
 
 
226 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.19 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 
230 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
236 aa  179  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  42.79 
 
 
229 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  40 
 
 
227 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  43.18 
 
 
241 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  42.47 
 
 
232 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.77 
 
 
237 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  40.71 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
224 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.1 
 
 
259 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 
235 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 
230 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.52 
 
 
230 aa  178  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.09 
 
 
258 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  43.12 
 
 
255 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  40.44 
 
 
227 aa  178  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  38.99 
 
 
226 aa  177  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  42.2 
 
 
235 aa  177  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
227 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  47.3 
 
 
272 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  43 
 
 
227 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  39.64 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  40.18 
 
 
249 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.55 
 
 
236 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  51.58 
 
 
269 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  44.59 
 
 
238 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.64 
 
 
224 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  48.13 
 
 
261 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
224 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
224 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  42.92 
 
 
226 aa  175  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  44.75 
 
 
241 aa  176  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.51 
 
 
232 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  43.84 
 
 
223 aa  176  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2517  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
255 aa  175  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  38.94 
 
 
228 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
219 aa  175  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  40.27 
 
 
236 aa  175  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.07 
 
 
228 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  48.77 
 
 
254 aa  175  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  53.4 
 
 
243 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  42.99 
 
 
227 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
245 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.86 
 
 
225 aa  174  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.59 
 
 
233 aa  174  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>