More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0812 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  69.91 
 
 		 238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  69.64 
 
 		 228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  64.68 
 
 		 225 aa  275  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  63.59 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  60.71 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  60.47 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.5 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  61.84 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  59.64 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  59.63 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  59.07 
 
 		 226 aa  237  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  56.28 
 
 		 305 aa  235  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.14 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  56.11 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.61 
 
 		 242 aa  221  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4160  ABC transporter related  60 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.77 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.64 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.96 
 
 		 357 aa  211  5.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  57.55 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.84 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  47.96 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  45.7 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.26 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  45.93 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  46.58 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  42.6 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  45.7 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  43.46 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  46.61 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  46.93 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.07 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  47.55 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  49.5 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  45.29 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  50.49 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  43.36 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  42.73 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  42.66 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  47 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  42.67 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  42.4 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.47 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  36.36 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2062  ABC transporter related  48.18 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  42.67 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  39.27 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  45.16 
 
 		 644 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.87 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.95 
 
 		 242 aa  179  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  49.5 
 
 		 227 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 262 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.94 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  49.25 
 
 		 248 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.46 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  44.34 
 
 		 657 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  45.91 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2517  ABC transporter related protein  43.66 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  45.26 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  44.44 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>