More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2062 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2062  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0066  ABC transporter related  69.23 
 
 
236 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2106  ABC transporter related  62.44 
 
 
248 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.61282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
226 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 
221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 
234 aa  194  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  47.79 
 
 
221 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  47.11 
 
 
222 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
222 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  43.95 
 
 
230 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  49.56 
 
 
226 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.88 
 
 
236 aa  188  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
654 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
224 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  47.3 
 
 
225 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.61 
 
 
233 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
233 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.61 
 
 
233 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0544  ABC transporter related  50.67 
 
 
219 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
233 aa  185  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  44.78 
 
 
232 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  48.87 
 
 
258 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
240 aa  185  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
229 aa  184  8e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  43.75 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.29 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.84 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.2 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 
235 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
246 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
218 aa  182  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 
242 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  47.3 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  44.75 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  45.65 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.52 
 
 
644 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  45.65 
 
 
249 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  45.65 
 
 
249 aa  181  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  44 
 
 
654 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
236 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.95 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.84 
 
 
237 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.7 
 
 
234 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.95 
 
 
253 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.95 
 
 
231 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  43.5 
 
 
715 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.95 
 
 
253 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.05 
 
 
646 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
217 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  44.44 
 
 
253 aa  179  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  44.44 
 
 
232 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.27 
 
 
233 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  48.18 
 
 
228 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  43.5 
 
 
663 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
216 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.84 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  44.39 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  43.48 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.15 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.84 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  42.6 
 
 
231 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  51.23 
 
 
224 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  44.21 
 
 
249 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.99 
 
 
642 aa  179  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  39.46 
 
 
235 aa  179  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2413  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
253 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.22 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  41.52 
 
 
233 aa  178  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0905  ABC transporter related  43.36 
 
 
243 aa  178  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.072369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  42.79 
 
 
236 aa  178  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
408 aa  177  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.05 
 
 
230 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  40.81 
 
 
234 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  43.95 
 
 
241 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.5 
 
 
233 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
234 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
241 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.07 
 
 
225 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  46.22 
 
 
232 aa  176  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  42.22 
 
 
226 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  42.34 
 
 
244 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>