More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3127 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  100 
 
 		 289 aa  557  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  58.8 
 
 		 280 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  60.73 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  59.91 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  64.86 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.37 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.01 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.1 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  57.55 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  56.48 
 
 		 357 aa  228  7e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  55.66 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.09 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  58.53 
 
 		 228 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  59.56 
 
 		 234 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  57.01 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 238 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.22 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.21 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  56.6 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  50.46 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 244 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  43.52 
 
 		 232 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  44.95 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  53 
 
 		 242 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  44.33 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 249 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  46.46 
 
 		 247 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.5 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.46 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  46.09 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  48.17 
 
 		 242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  47.86 
 
 		 654 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  42.33 
 
 		 217 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 256 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.02 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.02 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.5 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  48.28 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.31 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  46.79 
 
 		 233 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  44.75 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  42.01 
 
 		 223 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  43.75 
 
 		 233 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  47.51 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  44.35 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.02 
 
 		 235 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 231 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  49.49 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 		 248 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41 
 
 		 223 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  45.05 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.61 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  45.91 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  47.03 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  44 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  39.62 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  42.73 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1367  ATPase  46.39 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  39.38 
 
 		 239 aa  177  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  45.38 
 
 		 671 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  48.78 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 230 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.63 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>