More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2822 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  100 
 
 		 234 aa  447  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  53.68 
 
 		 258 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  55.46 
 
 		 305 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  62.39 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.74 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  55.11 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.47 
 
 		 280 aa  205  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  53.88 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  51.57 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  52.91 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  59.56 
 
 		 289 aa  198  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  51.16 
 
 		 357 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.57 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  55.81 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.45 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  51.35 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.33 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  49.32 
 
 		 654 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  49.04 
 
 		 671 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  45.37 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.02 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  45.37 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  49.36 
 
 		 668 aa  177  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  49.36 
 
 		 668 aa  177  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.64 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.8 
 
 		 646 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.64 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.58 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  43.23 
 
 		 653 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.36 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0700  ABC transporter related protein  53.98 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 		 242 aa  174  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  42.65 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  42.73 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  47.06 
 
 		 655 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  48.47 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  46.64 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  42.98 
 
 		 663 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 246 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  43.81 
 
 		 687 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 249 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  43.56 
 
 		 241 aa  171  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  43.17 
 
 		 661 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  42.98 
 
 		 663 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.62 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  45.13 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  43.81 
 
 		 306 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.96 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  40.43 
 
 		 646 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  42.18 
 
 		 641 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  42.18 
 
 		 641 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 242 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  40.38 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  43.81 
 
 		 681 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  43.81 
 
 		 681 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 		 643 aa  169  5e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.69 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  42.18 
 
 		 641 aa  168  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 648 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.11 
 
 		 648 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  42.11 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  46.22 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.11 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2892  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.11 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  42.33 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  42.11 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  40.85 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.91 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.81 
 
 		 647 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  44.64 
 
 		 650 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  43.17 
 
 		 656 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  45.58 
 
 		 676 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  42.49 
 
 		 654 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.11 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.11 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  38.77 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  49.55 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  44.98 
 
 		 652 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  45.59 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.84 
 
 		 248 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  42.54 
 
 		 653 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  42.06 
 
 		 666 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.65 
 
 		 678 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.84 
 
 		 248 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  42.65 
 
 		 678 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  45.45 
 
 		 644 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>