More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0833 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  100 
 
 
224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.17 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.17 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  47.75 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.72 
 
 
242 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  47.56 
 
 
240 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.64 
 
 
239 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
227 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.6 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.09 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  46.36 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  45 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 
658 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.96 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
246 aa  210  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  47.56 
 
 
238 aa  209  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.78 
 
 
225 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  46.88 
 
 
246 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  51.46 
 
 
640 aa  209  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
643 aa  210  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.87 
 
 
229 aa  208  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 
236 aa  208  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.74 
 
 
233 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.46 
 
 
647 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.39 
 
 
236 aa  208  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.06 
 
 
239 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.06 
 
 
232 aa  208  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  47.77 
 
 
238 aa  208  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
228 aa  207  7e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  44.34 
 
 
654 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.48 
 
 
234 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.5 
 
 
230 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.48 
 
 
234 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  45.41 
 
 
244 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  47.52 
 
 
667 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.8 
 
 
242 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  44.44 
 
 
235 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  47.52 
 
 
667 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.58 
 
 
226 aa  206  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.5 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  50.49 
 
 
234 aa  206  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.5 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  46.9 
 
 
227 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
649 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  46.9 
 
 
648 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  45.05 
 
 
650 aa  205  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  46.9 
 
 
648 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
225 aa  205  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  50.25 
 
 
227 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  48.26 
 
 
234 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 
232 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  44.2 
 
 
238 aa  204  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  49.55 
 
 
641 aa  204  8e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 
233 aa  204  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.31 
 
 
235 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.01 
 
 
226 aa  203  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  44.64 
 
 
229 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.14 
 
 
230 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  49.01 
 
 
668 aa  203  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  47.06 
 
 
653 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.61 
 
 
665 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  47.06 
 
 
238 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.47 
 
 
234 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  45.54 
 
 
241 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  44.75 
 
 
226 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45 
 
 
227 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  50 
 
 
676 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.29 
 
 
227 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  41.82 
 
 
252 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  44.17 
 
 
236 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  45.5 
 
 
643 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 
253 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.7 
 
 
656 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  41.96 
 
 
253 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  51.49 
 
 
231 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  45.25 
 
 
678 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  48.61 
 
 
665 aa  202  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  50.73 
 
 
642 aa  202  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  45.25 
 
 
678 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.2 
 
 
230 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.5 
 
 
238 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.25 
 
 
678 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
220 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.02 
 
 
648 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  44.98 
 
 
247 aa  201  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  47.75 
 
 
232 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  42.29 
 
 
245 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 
240 aa  201  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  43.75 
 
 
652 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.12 
 
 
234 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>