More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  60 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.64 
 
 		 280 aa  238  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  57.21 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  58.72 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  55.61 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  57.14 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  59.53 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.99 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.52 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  53.73 
 
 		 357 aa  208  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 225 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.8 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  53.02 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  53.37 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  48.23 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  54.09 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.17 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  52.8 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.77 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  48.87 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.09 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  42.47 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  48.11 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  44.8 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.11 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.28 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  43.86 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.89 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.62 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.62 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 		 242 aa  178  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  48.74 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.46 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.34 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  44.19 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  44.34 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  43.05 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  44.26 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  41.01 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.91 
 
 		 258 aa  174  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 242 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  46.27 
 
 		 277 aa  174  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  41.63 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  47.26 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.97 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.77 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.12 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  48.26 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  44.8 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.5 
 
 		 228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  46.57 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  41.94 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  45.12 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  45.12 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  45.12 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  41.86 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  44.61 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 648 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.44 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.92 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.71 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  41.96 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  42.45 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.65 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.09 
 
 		 648 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  47.66 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  45.21 
 
 		 227 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.41 
 
 		 252 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  45.21 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  43.6 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  50 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  40.8 
 
 		 293 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>