More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3828 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  63.26 
 
 		 225 aa  281  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  67.28 
 
 		 227 aa  279  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  64.22 
 
 		 225 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  62.62 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  64.19 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  58.85 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  59.07 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  60.45 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  57.47 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  54.38 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  55.81 
 
 		 280 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  56.88 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  57.21 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.88 
 
 		 357 aa  215  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.88 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  56.95 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4160  ABC transporter related  57.34 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.8 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.94 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  56.6 
 
 		 289 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  46.79 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.09 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  43.12 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0700  ABC transporter related protein  50.87 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  45.75 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.05 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.05 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.02 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  38.99 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  51.38 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  44.59 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  46.12 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.24 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  46.04 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  41.31 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  46.83 
 
 		 455 aa  168  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  42.53 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  36.53 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  43.64 
 
 		 247 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0380  ABC transporter related protein  56.42 
 
 		 243 aa  167  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  45.54 
 
 		 255 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 253 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 253 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 231 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 253 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  44.24 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  44.59 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  36.99 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  44.08 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  47.49 
 
 		 671 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  45.25 
 
 		 651 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  46.73 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  44.7 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  41.41 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  41.33 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 262 aa  165  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.54 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  39.73 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  52.53 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0341  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  40.91 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 271 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  39.37 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  40.45 
 
 		 227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  45.85 
 
 		 315 aa  164  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 277 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  48 
 
 		 257 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3612  ABC transporter related  45.45 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  45.33 
 
 		 258 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  38.01 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  44.95 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  47.95 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>