More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4690 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 
243 aa  473  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  57.92 
 
 
250 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  56.19 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.43 
 
 
232 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.75 
 
 
228 aa  215  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  50.67 
 
 
225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.19 
 
 
239 aa  214  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.11 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.48 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.61 
 
 
242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  54.23 
 
 
288 aa  211  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
228 aa  211  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.32 
 
 
266 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  44 
 
 
241 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  47.58 
 
 
228 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  50.23 
 
 
228 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
233 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.02 
 
 
237 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
238 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.51 
 
 
252 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 
232 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.9 
 
 
247 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.48 
 
 
234 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  43.11 
 
 
241 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.48 
 
 
234 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.02 
 
 
241 aa  205  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.11 
 
 
230 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.29 
 
 
225 aa  205  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 
222 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.22 
 
 
248 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.22 
 
 
248 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  48.22 
 
 
220 aa  204  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 
227 aa  204  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
246 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  204  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
240 aa  204  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.49 
 
 
252 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  46.79 
 
 
653 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  50.48 
 
 
678 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
236 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.48 
 
 
678 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
228 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  44.24 
 
 
241 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  50.48 
 
 
678 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
224 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.93 
 
 
233 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.25 
 
 
236 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
240 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
224 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.91 
 
 
236 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  43.56 
 
 
228 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.14 
 
 
236 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
224 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
224 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
224 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
221 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  42.4 
 
 
249 aa  203  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.27 
 
 
226 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  47.32 
 
 
233 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  44.39 
 
 
238 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  49.34 
 
 
655 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 
241 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  46.36 
 
 
653 aa  201  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
224 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
265 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.42 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  47.69 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.36 
 
 
228 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.91 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  53 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  53.15 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.11 
 
 
648 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
228 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.54 
 
 
649 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.93 
 
 
230 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.54 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  45.5 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.61 
 
 
653 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  42.6 
 
 
224 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
227 aa  198  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.05 
 
 
238 aa  198  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
240 aa  198  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 
224 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  45.09 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  50.69 
 
 
654 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>