More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  73.83 
 
 		 225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  68.37 
 
 		 225 aa  301  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  69.48 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  70.83 
 
 		 228 aa  281  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  64.22 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  67.28 
 
 		 226 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  61.5 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  60.47 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  58.45 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  55.87 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  52.25 
 
 		 305 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  56.48 
 
 		 242 aa  215  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  53 
 
 		 357 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53 
 
 		 259 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.43 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.97 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.8 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  55.4 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4160  ABC transporter related  57.27 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  38.74 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.06 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.06 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  43.28 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  39.64 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.52 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  42.13 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  54.21 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  41.59 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  43.64 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  43.64 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  44.75 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  40.45 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  45.66 
 
 		 643 aa  181  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  47.06 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  46.04 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  44.44 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  36.99 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  39.52 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  39.55 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.78 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.7 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  45.67 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 230 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  44.75 
 
 		 651 aa  177  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  41.36 
 
 		 652 aa  177  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  40.09 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  47.8 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  41.85 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  41.85 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  43.81 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.34 
 
 		 644 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  45.05 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.79 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1619  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.281163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  44.24 
 
 		 247 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>