More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0967 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  499  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.78 
 
 
236 aa  195  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.61 
 
 
242 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
233 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 
234 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.66 
 
 
238 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  53.96 
 
 
248 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  50 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  50 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
234 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
234 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  49.55 
 
 
227 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.97 
 
 
233 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 
233 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.29 
 
 
233 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 
233 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 
233 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.15 
 
 
232 aa  188  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 
249 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  45.74 
 
 
238 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 
224 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.23 
 
 
230 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.9 
 
 
238 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.5 
 
 
238 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 
235 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.64 
 
 
237 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.51 
 
 
233 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.51 
 
 
234 aa  185  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.24 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.93 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  49.27 
 
 
231 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  45.91 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  48.87 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51 
 
 
230 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  52.31 
 
 
232 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.75 
 
 
235 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.74 
 
 
226 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.74 
 
 
226 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.47 
 
 
252 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.48 
 
 
237 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 
239 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  45.16 
 
 
226 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2073  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
236 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.87 
 
 
231 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  49.1 
 
 
232 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  48.11 
 
 
240 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.29 
 
 
233 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.24 
 
 
231 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  47.96 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  50 
 
 
250 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.51 
 
 
228 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  45.37 
 
 
249 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  45.37 
 
 
249 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  50.49 
 
 
227 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  45.37 
 
 
249 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  45.71 
 
 
235 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  46.49 
 
 
227 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.24 
 
 
224 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.19 
 
 
235 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  50.24 
 
 
227 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  45.1 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
219 aa  178  7e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
225 aa  178  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
224 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  47.34 
 
 
234 aa  178  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
228 aa  178  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.8 
 
 
235 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  49.03 
 
 
280 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.81 
 
 
236 aa  178  9e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  49.76 
 
 
224 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  45.57 
 
 
243 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  46.29 
 
 
227 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  50.25 
 
 
228 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.75 
 
 
240 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.02 
 
 
253 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.68 
 
 
253 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  48.9 
 
 
261 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.02 
 
 
253 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.76 
 
 
318 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  46.29 
 
 
228 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  50 
 
 
233 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  52.22 
 
 
248 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  50.49 
 
 
235 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.06 
 
 
252 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  47.55 
 
 
230 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.06 
 
 
252 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.95 
 
 
229 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  52.31 
 
 
243 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  45.59 
 
 
246 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.06 
 
 
253 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>