More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3314 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  100 
 
 		 643 aa  1293    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  35.07 
 
 		 662 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  35.23 
 
 		 664 aa  345  1e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 664 aa  343  4e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  33.23 
 
 		 660 aa  335  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.21 
 
 		 649 aa  293  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.01 
 
 		 642 aa  292  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  32.44 
 
 		 653 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.91 
 
 		 649 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.71 
 
 		 656 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.55 
 
 		 648 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.38 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  31.57 
 
 		 667 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  31.57 
 
 		 667 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  31.07 
 
 		 652 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  31.12 
 
 		 656 aa  281  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  32.74 
 
 		 661 aa  281  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 		 654 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  29.5 
 
 		 652 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  30.62 
 
 		 649 aa  278  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  31.47 
 
 		 682 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  30.62 
 
 		 650 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 643 aa  276  6e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  30.74 
 
 		 678 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.74 
 
 		 678 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  31.04 
 
 		 682 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  31.09 
 
 		 671 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.59 
 
 		 678 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  44.38 
 
 		 779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  30.44 
 
 		 666 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  31.56 
 
 		 646 aa  273  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  31.65 
 
 		 652 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  33.82 
 
 		 641 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  33.82 
 
 		 641 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.36 
 
 		 644 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  30.14 
 
 		 696 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.19 
 
 		 647 aa  270  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  33.82 
 
 		 641 aa  270  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.84 
 
 		 657 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  32.03 
 
 		 647 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.66 
 
 		 648 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.12 
 
 		 648 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  30.16 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 648 aa  264  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.16 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.72 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  30.16 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.16 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  29.66 
 
 		 653 aa  264  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.37 
 
 		 648 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.01 
 
 		 648 aa  263  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.02 
 
 		 651 aa  263  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  29.68 
 
 		 653 aa  263  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.96 
 
 		 642 aa  263  8e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.73 
 
 		 888 aa  263  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.1 
 
 		 641 aa  263  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  30.7 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.37 
 
 		 648 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  31.74 
 
 		 656 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.37 
 
 		 648 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.94 
 
 		 950 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.22 
 
 		 648 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  28.61 
 
 		 648 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.44 
 
 		 643 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  43.54 
 
 		 779 aa  258  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.85 
 
 		 646 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  29.79 
 
 		 648 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  29.79 
 
 		 648 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  30.22 
 
 		 654 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  49.27 
 
 		 885 aa  257  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  45.22 
 
 		 1090 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  30.18 
 
 		 657 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  29.88 
 
 		 651 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  46.32 
 
 		 1130 aa  249  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  30.1 
 
 		 645 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  27.96 
 
 		 655 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  27.86 
 
 		 681 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  27.86 
 
 		 681 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  27.07 
 
 		 687 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 226 aa  243  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  31.04 
 
 		 665 aa  242  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 226 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.96 
 
 		 653 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 226 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 226 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 226 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 226 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 226 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 226 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 226 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 226 aa  241  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.89 
 
 		 226 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 226 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  28.69 
 
 		 676 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  28.68 
 
 		 652 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.55 
 
 		 244 aa  237  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.17 
 
 		 653 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  28.72 
 
 		 668 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.05 
 
 		 653 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.17 
 
 		 653 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>