More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1399 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1399  ABC transporter related  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1866  ABC transporter related  96.86 
 
 
226 aa  411  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.937641  normal  0.767645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  85.58 
 
 
239 aa  385  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  86.05 
 
 
223 aa  385  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  61.43 
 
 
243 aa  275  6e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  61.75 
 
 
238 aa  270  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.56 
 
 
235 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 
221 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.23 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  53.02 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  53.02 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  50.49 
 
 
223 aa  208  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
236 aa  206  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  49.34 
 
 
236 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  50.99 
 
 
264 aa  206  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  53.49 
 
 
222 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  53.46 
 
 
222 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  53.21 
 
 
253 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  50.69 
 
 
233 aa  204  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50 
 
 
231 aa  204  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  53.21 
 
 
253 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  51.83 
 
 
228 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  54.46 
 
 
221 aa  203  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  48.64 
 
 
250 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50.98 
 
 
238 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  45.66 
 
 
224 aa  202  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
252 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  52.88 
 
 
276 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  47.39 
 
 
217 aa  201  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  54.46 
 
 
236 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.98 
 
 
237 aa  201  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.86 
 
 
225 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.37 
 
 
234 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  52.66 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  51.15 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  50.23 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.7 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  50.5 
 
 
224 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.37 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.67 
 
 
230 aa  198  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  53.08 
 
 
239 aa  198  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  49.32 
 
 
224 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47.03 
 
 
225 aa  197  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  52.5 
 
 
227 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  50.23 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.09 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.91 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  46.85 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  45.98 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  46.85 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  50.48 
 
 
230 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  47.96 
 
 
226 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.57 
 
 
235 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  47 
 
 
226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  50.48 
 
 
260 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.21 
 
 
228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  49.31 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  47.62 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.71 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  48.39 
 
 
228 aa  195  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  47.51 
 
 
228 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  50 
 
 
217 aa  195  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 
227 aa  194  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
224 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  46.34 
 
 
293 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.4 
 
 
225 aa  194  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.31 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  49.01 
 
 
224 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  48.34 
 
 
234 aa  194  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.9 
 
 
246 aa  194  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  53.69 
 
 
234 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.86 
 
 
252 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  49.5 
 
 
247 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.93 
 
 
234 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
228 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
235 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.51 
 
 
241 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  51.2 
 
 
228 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.51 
 
 
247 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.29 
 
 
232 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.01 
 
 
247 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  50.74 
 
 
234 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.58 
 
 
252 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
246 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  51.94 
 
 
287 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  46.43 
 
 
244 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>