More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1404 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  61.36 
 
 
239 aa  276  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  59.83 
 
 
238 aa  276  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  59.82 
 
 
223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1866  ABC transporter related  62.9 
 
 
226 aa  256  3e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.937641  normal  0.767645 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1399  ABC transporter related  62.84 
 
 
223 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.79 
 
 
235 aa  232  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.53 
 
 
225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.44 
 
 
234 aa  224  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.44 
 
 
234 aa  224  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  54.34 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  54.34 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  49.09 
 
 
231 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  47.75 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.58 
 
 
225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
236 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  54.37 
 
 
236 aa  211  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.4 
 
 
230 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.4 
 
 
242 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  48.89 
 
 
253 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
246 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  48.15 
 
 
230 aa  208  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  50.91 
 
 
233 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  54.41 
 
 
236 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  51.77 
 
 
239 aa  204  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
238 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
228 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  47.64 
 
 
250 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.95 
 
 
252 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  46.15 
 
 
225 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.06 
 
 
266 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  56.76 
 
 
276 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  47.49 
 
 
230 aa  202  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.66 
 
 
248 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.66 
 
 
248 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.29 
 
 
242 aa  201  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.2 
 
 
252 aa  201  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  45.25 
 
 
256 aa  201  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
219 aa  201  9e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
228 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  45.62 
 
 
244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  46.54 
 
 
221 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  49.32 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  53.88 
 
 
287 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  45.62 
 
 
220 aa  198  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.88 
 
 
230 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  47.14 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  53.05 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.67 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.61 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  45.74 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  47.58 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  47.14 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  47.14 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  50.25 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  47.81 
 
 
232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  47.14 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
230 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  45.16 
 
 
220 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  47.51 
 
 
234 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  46.49 
 
 
246 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  46.49 
 
 
246 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  46.49 
 
 
246 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  46.54 
 
 
226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.48 
 
 
230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.95 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  48.17 
 
 
217 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  45.45 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  48.18 
 
 
263 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.14 
 
 
226 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  47.14 
 
 
232 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
227 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  43.59 
 
 
244 aa  195  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  47.32 
 
 
234 aa  194  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  45.21 
 
 
251 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
230 aa  194  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  48.37 
 
 
238 aa  194  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
220 aa  194  8.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  45.25 
 
 
298 aa  194  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
253 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 
229 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
229 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  51.6 
 
 
276 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.62 
 
 
259 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 
226 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  45.11 
 
 
254 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  48.18 
 
 
253 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.24 
 
 
229 aa  193  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
226 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
226 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
226 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  47.85 
 
 
235 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
226 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>