More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2097 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  56.31 
 
 
235 aa  248  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  54.5 
 
 
235 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.88 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.61 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.61 
 
 
232 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.15 
 
 
256 aa  211  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
264 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.15 
 
 
239 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.18 
 
 
239 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.18 
 
 
240 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.64 
 
 
237 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.05 
 
 
225 aa  204  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  43.78 
 
 
234 aa  204  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 
233 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  47.51 
 
 
238 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 
230 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.73 
 
 
231 aa  202  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  46.85 
 
 
233 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 
221 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  46.61 
 
 
654 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  45.33 
 
 
225 aa  201  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.05 
 
 
225 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  45.25 
 
 
248 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
234 aa  201  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.45 
 
 
277 aa  201  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  44.49 
 
 
652 aa  201  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.27 
 
 
234 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.27 
 
 
234 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  45.54 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.78 
 
 
648 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  42.73 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
228 aa  198  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 
233 aa  198  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  42.61 
 
 
652 aa  198  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.5 
 
 
235 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  46.4 
 
 
650 aa  197  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  45.5 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  43.69 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  48.46 
 
 
653 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  48.66 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  44.84 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  45.5 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  46.78 
 
 
650 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.7 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  46.82 
 
 
654 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  45.45 
 
 
233 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 
233 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  45.45 
 
 
233 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
233 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
233 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
233 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
233 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
230 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  43.17 
 
 
232 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
233 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  44.14 
 
 
241 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.8 
 
 
235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  44.55 
 
 
249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  43.64 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.05 
 
 
653 aa  195  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.8 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 
226 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  45 
 
 
228 aa  195  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  44.35 
 
 
244 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  49.03 
 
 
233 aa  194  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  43.35 
 
 
234 aa  194  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 
224 aa  194  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
225 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.84 
 
 
235 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.34 
 
 
251 aa  194  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.8 
 
 
234 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1717  ABC transporter related  48.21 
 
 
248 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44 
 
 
248 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
233 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  47.3 
 
 
250 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  41.52 
 
 
643 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  44.14 
 
 
241 aa  193  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  49.32 
 
 
252 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  44.34 
 
 
226 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  43.64 
 
 
244 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 
222 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  47.3 
 
 
242 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0956  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
346 aa  192  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121187  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  44.64 
 
 
455 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.45 
 
 
242 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
224 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  46.15 
 
 
248 aa  192  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  44.2 
 
 
232 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.67 
 
 
646 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
236 aa  191  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 
260 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
226 aa  191  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  44.29 
 
 
233 aa  191  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  45.41 
 
 
234 aa  191  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  44.29 
 
 
223 aa  191  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>