More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1717 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1717  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  48.88 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.18 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.79 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  46.61 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.06 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  47.75 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  46.29 
 
 		 565 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.44 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.15 
 
 		 232 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.64 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.15 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.44 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.3 
 
 		 249 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.89 
 
 		 237 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  48.65 
 
 		 243 aa  187  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.19 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  44.89 
 
 		 563 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  48.2 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.61 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.85 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.95 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.98 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 230 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.6 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.89 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  41.25 
 
 		 286 aa  184  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.05 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  47.06 
 
 		 707 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.44 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.18 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.5 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 648 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 		 224 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 		 224 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.44 
 
 		 648 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 224 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  43.44 
 
 		 648 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.44 
 
 		 648 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  43.44 
 
 		 648 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  43.89 
 
 		 646 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.44 
 
 		 648 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  44.59 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.44 
 
 		 648 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  46.33 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.44 
 
 		 648 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.67 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  42.92 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  46.9 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  43.95 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.53 
 
 		 648 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.26 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  43.1 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  43.89 
 
 		 229 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  45.37 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.53 
 
 		 648 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  40.62 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  42.86 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.53 
 
 		 648 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.08 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>