More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2375 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  54.91 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 230 aa  251  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  54.67 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  54.22 
 
 		 234 aa  247  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.19 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  51.11 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.07 
 
 		 227 aa  237  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  51.35 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  52.25 
 
 		 237 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  49.55 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0433  ABC transporter related  50.88 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  48.65 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  47.73 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  51.35 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.54 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  47.75 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  46.02 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  44.89 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  48.18 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  45.13 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.49 
 
 		 648 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.69 
 
 		 648 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  47.11 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  45.61 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.69 
 
 		 648 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.49 
 
 		 648 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.49 
 
 		 648 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  44.14 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1950  ABC transporter related  48.87 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458128  normal  0.0230529 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1744  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.08 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.26 
 
 		 648 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.91 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.75 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  44.75 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.36 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  44.8 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.29 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  44.8 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.36 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  44.8 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2904  ABC transporter-like protein  49.09 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.108903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  45.18 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.81 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  45.66 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  44.25 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  42.73 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.09 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.05 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.05 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.61 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  46.64 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  42.67 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.89 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.95 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.42 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.73 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  45.25 
 
 		 235 aa  197  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 648 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  46.4 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.45 
 
 		 648 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.81 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  43.81 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  43.11 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  46.61 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  46.05 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3462  ABC transporter related  46.9 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  43.44 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  40.45 
 
 		 293 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45 
 
 		 648 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45 
 
 		 648 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  45.29 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>