More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2973 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  100 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50.45 
 
 
242 aa  241  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  53.52 
 
 
230 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  52.61 
 
 
244 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
224 aa  238  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
224 aa  238  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 
224 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
224 aa  236  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
224 aa  236  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.69 
 
 
237 aa  236  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  50.7 
 
 
224 aa  235  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  51.96 
 
 
241 aa  235  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 
224 aa  235  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 
224 aa  235  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 
228 aa  235  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 
224 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50 
 
 
246 aa  234  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  51.47 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  52.58 
 
 
239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  51.16 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
224 aa  232  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
240 aa  232  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.75 
 
 
230 aa  232  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  50.7 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.24 
 
 
239 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  50.23 
 
 
228 aa  230  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  49.3 
 
 
230 aa  229  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  49.3 
 
 
260 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  49.76 
 
 
241 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 
253 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.89 
 
 
226 aa  229  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  48.83 
 
 
236 aa  228  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.83 
 
 
253 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  47.87 
 
 
224 aa  228  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  48.83 
 
 
229 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  51.64 
 
 
242 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.3 
 
 
253 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.96 
 
 
230 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  50.7 
 
 
247 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  48.83 
 
 
244 aa  226  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  53.03 
 
 
236 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  49.3 
 
 
229 aa  226  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.34 
 
 
237 aa  225  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.34 
 
 
228 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
233 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.82 
 
 
252 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.77 
 
 
225 aa  224  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.23 
 
 
255 aa  224  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47.71 
 
 
225 aa  224  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  52.63 
 
 
241 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.83 
 
 
239 aa  223  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.83 
 
 
232 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.85 
 
 
238 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.76 
 
 
248 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  46.95 
 
 
233 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  49.76 
 
 
248 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  51.8 
 
 
227 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  50.7 
 
 
241 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  50.7 
 
 
241 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  47.42 
 
 
291 aa  222  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  50.7 
 
 
241 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  51.17 
 
 
225 aa  221  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.31 
 
 
225 aa  221  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.5 
 
 
242 aa  221  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 
221 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
238 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  47.42 
 
 
238 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  50.7 
 
 
243 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.24 
 
 
266 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 
253 aa  218  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.3 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  52.31 
 
 
234 aa  217  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  49.08 
 
 
232 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  52.31 
 
 
234 aa  217  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.15 
 
 
230 aa  217  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 
226 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  49.54 
 
 
235 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  47.25 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  48.1 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.48 
 
 
247 aa  215  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.2 
 
 
277 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  50.9 
 
 
231 aa  215  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  49.51 
 
 
240 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48.6 
 
 
241 aa  215  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.37 
 
 
235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  46.95 
 
 
220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 
230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.87 
 
 
248 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  214  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>