More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2371 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
430 aa  865    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  82.12 
 
 
426 aa  685    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  55.33 
 
 
440 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  45.8 
 
 
415 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  42.93 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  41.69 
 
 
412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.33 
 
 
409 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
420 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  36.06 
 
 
420 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
406 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
422 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
422 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 
454 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.44 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
411 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
416 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
406 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
409 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
407 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  42.11 
 
 
401 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
409 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  34.09 
 
 
403 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
407 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.71 
 
 
400 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.31 
 
 
408 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
411 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  33.41 
 
 
452 aa  170  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
400 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  30.88 
 
 
414 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
400 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
417 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
425 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
452 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  34.06 
 
 
443 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
417 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
404 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
426 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
415 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.06 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.93 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 
395 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
413 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.62 
 
 
406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.62 
 
 
406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
403 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 
904 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.91 
 
 
406 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.91 
 
 
406 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.91 
 
 
406 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.4 
 
 
411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.94 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  38.39 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  26.24 
 
 
419 aa  126  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.41 
 
 
406 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
406 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
406 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
406 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.79 
 
 
406 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.14 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  26.7 
 
 
654 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.41 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
410 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
1302 aa  113  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 
367 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
368 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
394 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
378 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
398 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  37.26 
 
 
394 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
374 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
400 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
355 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
360 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.75 
 
 
366 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
377 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
395 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
383 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
390 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>