More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0840 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
401 aa  794    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  52.64 
 
 
404 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  53.27 
 
 
405 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  53.27 
 
 
405 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  54.02 
 
 
407 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  48.87 
 
 
400 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  48.99 
 
 
411 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.99 
 
 
400 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  44.5 
 
 
407 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  47.99 
 
 
400 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  51.26 
 
 
408 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  44.97 
 
 
400 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
409 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
414 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.25 
 
 
407 aa  202  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
411 aa  189  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.56 
 
 
409 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
406 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
415 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
412 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  32.92 
 
 
452 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
430 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.36 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
410 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  31.64 
 
 
414 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
409 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
416 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
437 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
410 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.36 
 
 
406 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.83 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  31.11 
 
 
403 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.36 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.12 
 
 
406 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
426 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.36 
 
 
406 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  30.77 
 
 
443 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  26.7 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.23 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.23 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  29.88 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
904 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.57 
 
 
360 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
417 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
425 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.47 
 
 
406 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
413 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.64 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  27.22 
 
 
373 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
360 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
406 aa  106  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
390 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  39.47 
 
 
440 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  29.98 
 
 
414 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
406 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28 
 
 
406 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.24 
 
 
406 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
377 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
403 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
395 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.9 
 
 
365 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
405 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
364 aa  100  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
439 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
398 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
407 aa  96.7  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
372 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
401 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  46.46 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
383 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
310 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
351 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
371 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  33.48 
 
 
426 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
395 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
350 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.95 
 
 
419 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
417 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>