More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1613 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  98.03 
 
 		 406 aa  819    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 406 aa  835    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  98.77 
 
 		 406 aa  824    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  85.22 
 
 		 406 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  99.01 
 
 		 406 aa  830    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  84.73 
 
 		 406 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  85.96 
 
 		 406 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  98.77 
 
 		 406 aa  823    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  83.25 
 
 		 406 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  99.01 
 
 		 406 aa  828    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  85.47 
 
 		 406 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  85.47 
 
 		 406 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  98.77 
 
 		 406 aa  826    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  98.03 
 
 		 406 aa  819    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  38.74 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 904 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.09 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.73 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.51 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  42.13 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  26.01 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 407 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  26.23 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 410 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  27.29 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 452 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 378 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 377 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  37.82 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 1302 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 348 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 		 473 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  27.27 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>