More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4012 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
403 aa  810    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
409 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
452 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
410 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
417 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
440 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
410 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  32.61 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  29.44 
 
 
411 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
425 aa  126  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
415 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
417 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
416 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  29.32 
 
 
443 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  29.62 
 
 
654 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
367 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
415 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
415 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.94 
 
 
407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
417 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
412 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
417 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
411 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
414 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
406 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
410 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.33 
 
 
406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
395 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
414 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.08 
 
 
406 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
413 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.83 
 
 
406 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  28.95 
 
 
414 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
904 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.83 
 
 
406 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.83 
 
 
406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
373 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  29.1 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  27.75 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  27.75 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.11 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.25 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.93 
 
 
400 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.71 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.86 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.01 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
394 aa  86.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
405 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  38.99 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  25.66 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  26.78 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
1302 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>