More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5975 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  92.05 
 
 
415 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
415 aa  839    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  70.77 
 
 
415 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  66.91 
 
 
411 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  53.2 
 
 
426 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  54.13 
 
 
413 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  52.61 
 
 
405 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  47.95 
 
 
414 aa  348  7e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  42.13 
 
 
416 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 
410 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  38.69 
 
 
420 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 
420 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  37.35 
 
 
443 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
454 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
417 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  34.47 
 
 
452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
422 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
422 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  34.46 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 
410 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
411 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
410 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
417 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
452 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
430 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
406 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
412 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
440 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.09 
 
 
407 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
426 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.31 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  35.55 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.64 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  29.43 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
395 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  29.54 
 
 
654 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
410 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
415 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
411 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
401 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
407 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
400 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
386 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  31.78 
 
 
419 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
414 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.29 
 
 
400 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  36.36 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 
366 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
400 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.93 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
364 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  33.85 
 
 
638 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 
770 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
453 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 
356 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
350 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 
366 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
381 aa  87  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
1302 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  24.35 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.47 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  24.35 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.58 
 
 
406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
364 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.7 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.46 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  22.84 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  29.44 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
425 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>