More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2716 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  93.5 
 
 
400 aa  755    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  83.75 
 
 
400 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  813    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  93.5 
 
 
411 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  60.1 
 
 
408 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  50.38 
 
 
407 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  50.13 
 
 
404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  48.12 
 
 
405 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  48.12 
 
 
405 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  48.22 
 
 
407 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
414 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  42.11 
 
 
400 aa  242  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
409 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
411 aa  223  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
406 aa  222  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.41 
 
 
409 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  36.47 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.09 
 
 
407 aa  217  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
426 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
440 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  30.15 
 
 
452 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  30.53 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
422 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
417 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
417 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
410 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
437 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
412 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
426 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
410 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  30.17 
 
 
443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
409 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
416 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.71 
 
 
406 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.46 
 
 
406 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  28.57 
 
 
403 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.46 
 
 
406 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
454 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
425 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
406 aa  106  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.04 
 
 
360 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.2 
 
 
406 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
401 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.51 
 
 
350 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
452 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.95 
 
 
406 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
373 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
398 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
415 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.56 
 
 
406 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.56 
 
 
406 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  37.66 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.37 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  23.47 
 
 
419 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.49 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.45 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.39 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
367 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  29.41 
 
 
373 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
415 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
391 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
378 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.31 
 
 
346 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
377 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  24.88 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
904 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.42 
 
 
395 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  40.99 
 
 
372 aa  86.3  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
800 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>