More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0691 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
377 aa  769    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  43.9 
 
 
373 aa  328  8e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  48.22 
 
 
310 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
367 aa  222  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
376 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
377 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
360 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.98 
 
 
378 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.94 
 
 
360 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  35.86 
 
 
360 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
394 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  36 
 
 
373 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.17 
 
 
365 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
363 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
378 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
366 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
394 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
401 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  30.11 
 
 
350 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
407 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
407 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.18 
 
 
401 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
404 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
419 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
388 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
414 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
409 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  31.49 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
396 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
392 aa  94  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
374 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
419 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
446 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
411 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
374 aa  92.8  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
360 aa  92.8  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
426 aa  92.8  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.33 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
414 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  37.67 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
380 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
390 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.34 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
424 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
405 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.81 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
398 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.24 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.95 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
391 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
370 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
411 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
386 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
345 aa  89.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
368 aa  89.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
401 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.14 
 
 
423 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
416 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>