More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1938 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
401 aa  765    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
407 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  42.33 
 
 
440 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
415 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  41.42 
 
 
410 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  38.35 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 
426 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
420 aa  156  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
420 aa  156  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
409 aa  156  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
417 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
452 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
410 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  38.44 
 
 
412 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
417 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  39.04 
 
 
454 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  39.59 
 
 
410 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
406 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.13 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
406 aa  139  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 
417 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
415 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  33.08 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  34.39 
 
 
414 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.95 
 
 
407 aa  130  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
411 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  32.67 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.14 
 
 
405 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
373 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
426 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  36.72 
 
 
408 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
400 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  31.47 
 
 
443 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.6 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  31.03 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.81 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  38.43 
 
 
367 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
415 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.81 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 
425 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
414 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
404 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
407 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
400 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.71 
 
 
406 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.63 
 
 
406 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.33 
 
 
406 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 
404 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 
395 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
401 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
396 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.83 
 
 
406 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.83 
 
 
406 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
385 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
374 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 
396 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
409 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
374 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  35.58 
 
 
406 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 
405 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  35.1 
 
 
406 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.98 
 
 
406 aa  96.7  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  41.72 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  38.79 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
378 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
473 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  30.79 
 
 
654 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
403 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
386 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
904 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
359 aa  90.5  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
398 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
364 aa  90.1  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>