More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2056 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
473 aa  961    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  39.2 
 
 
452 aa  286  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  37.75 
 
 
410 aa  272  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
422 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
422 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
410 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
420 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
420 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
416 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  28.07 
 
 
654 aa  126  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
440 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
406 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  27.73 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  27.45 
 
 
452 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  28.19 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
426 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.11 
 
 
407 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
411 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
417 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  33.17 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  33.17 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
401 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
383 aa  107  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
414 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.74 
 
 
414 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
430 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.94 
 
 
406 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.94 
 
 
406 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
415 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.41 
 
 
406 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.89 
 
 
406 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.17 
 
 
406 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
406 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.17 
 
 
406 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.17 
 
 
406 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
406 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.72 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
425 aa  98.2  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.17 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
407 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  29.98 
 
 
405 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
417 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
409 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  28.27 
 
 
403 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
426 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
367 aa  86.7  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.49 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 
750 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
403 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
1302 aa  80.9  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.7 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
904 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.23 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.02 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
364 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  30.32 
 
 
419 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
382 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  35.57 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
350 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  35.36 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>