More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0279 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
385 aa  793    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  40.42 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
401 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
367 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
359 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
373 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
904 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
395 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.57 
 
 
406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.46 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.46 
 
 
406 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
406 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  30.28 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.86 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  30.28 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.49 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.12 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.58 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.2 
 
 
406 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.2 
 
 
406 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
406 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
394 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
395 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 
377 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
401 aa  96.3  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
410 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.5 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
383 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  22.96 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  20.91 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  20.21 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  19.16 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  19.54 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
410 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.83 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  20.89 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 
359 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.34 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  21.17 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  20.72 
 
 
415 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
440 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  21.72 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  19.19 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  28.02 
 
 
420 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  19.59 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  21.64 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.47 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  22.07 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  20.76 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
1302 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
689 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  19.44 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
417 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  20.97 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
408 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>