More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2745 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  99.51 
 
 
405 aa  789    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  85.06 
 
 
407 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
405 aa  793    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  51.52 
 
 
404 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  53.15 
 
 
401 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.37 
 
 
400 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  48.74 
 
 
411 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  47.72 
 
 
400 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  45.61 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  43.11 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  48.48 
 
 
408 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
414 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 
400 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
409 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
411 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
406 aa  209  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  37 
 
 
409 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
406 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.92 
 
 
407 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
412 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 
410 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
409 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
410 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
420 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
420 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
416 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  31.26 
 
 
414 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
417 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
410 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  33.41 
 
 
403 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
422 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  32.45 
 
 
452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
426 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
430 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
440 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
365 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  44.51 
 
 
750 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
401 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
904 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 
367 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  32.78 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  43.86 
 
 
739 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  30.14 
 
 
419 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
396 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
414 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  40.25 
 
 
358 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
392 aa  106  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
417 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
417 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 
377 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.81 
 
 
360 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  29.89 
 
 
373 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  33.91 
 
 
360 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
395 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
419 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
406 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
394 aa  103  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  27.36 
 
 
406 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 
395 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
364 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
367 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
407 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  27.36 
 
 
406 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  29.9 
 
 
411 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 
398 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
350 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
378 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
401 aa  99.8  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
419 aa  99.4  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
394 aa  99  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.95 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  43.23 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
364 aa  97.1  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
390 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
403 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  39.49 
 
 
415 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
364 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.23 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  29.33 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.87 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.27 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>