More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2078 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 377 aa  735    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  41.36 
 
 		 904 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  41.01 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  35.7 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  32.35 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  35.49 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  36.33 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  31.52 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.08 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  36.27 
 
 		 405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  33.22 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 417 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 420 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 420 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 417 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.36 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  37.15 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.14 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.38 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.38 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  32.71 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.03 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.69 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.94 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 406 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 		 414 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  31.79 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  31.79 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  33.58 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 770 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 446 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 426 aa  93.6  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.56 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  29.29 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  34 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 419 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.36 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 406 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.79 
 
 		 406 aa  89.7  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>