More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2124 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  100 
 
 		 391 aa  801    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  40.42 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 373 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 904 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.54 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.54 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.2 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.2 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  31.95 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.86 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  31.95 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.82 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.82 
 
 		 406 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.17 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 406 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.84 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.07 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  31.43 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  26.29 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  25.07 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  21.33 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.64 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.36 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  27.93 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  28.15 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 689 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  19.28 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  19.05 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  27.74 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.7 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  20.62 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  26.51 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>