More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0173 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
401 aa  835    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
385 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.99 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
395 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
373 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
904 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  31.3 
 
 
406 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  31.3 
 
 
406 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.48 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.08 
 
 
406 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.08 
 
 
406 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
378 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.3 
 
 
406 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.67 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.67 
 
 
406 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
417 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.3 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.3 
 
 
406 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.89 
 
 
406 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
417 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
419 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
377 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
406 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
381 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  25.17 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 
383 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
452 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
410 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.23 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.12 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.33 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.4 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  26.05 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25.21 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>