More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0459 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  100 
 
 		 350 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.9 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.18 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.09 
 
 		 363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  26.3 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.07 
 
 		 419 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.45 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  20.46 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.87 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 377 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 		 377 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  22.77 
 
 		 408 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 429 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 		 381 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.47 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  23.78 
 
 		 935 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.4 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  23.41 
 
 		 405 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  23.41 
 
 		 405 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 		 407 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 390 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 		 381 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.63 
 
 		 381 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.63 
 
 		 381 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 391 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.63 
 
 		 381 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 		 381 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 387 aa  93.2  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  27.32 
 
 		 411 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 		 399 aa  93.2  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 		 383 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 409 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 403 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 381 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  21.69 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>