More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1996 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
364 aa  751    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
396 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
366 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
374 aa  162  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
374 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
366 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
378 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
401 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
396 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
395 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
375 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
386 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
388 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
378 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
382 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
392 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
393 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
397 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
377 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
358 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
359 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
415 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
408 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
379 aa  99.4  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  25.2 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.63 
 
 
396 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.98 
 
 
402 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  28.49 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
360 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
381 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  29.35 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
378 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
400 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  30.77 
 
 
404 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
364 aa  85.9  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
748 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.81 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.11 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.95 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.95 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.95 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
761 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  26.42 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.66 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  24.24 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.6 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.62 
 
 
375 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.2 
 
 
401 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4807  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.43 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.89 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.98 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
763 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>