More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2306 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 379 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  47.21 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  43.87 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  43.46 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  43.73 
 
 		 374 aa  275  9e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  39.62 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  37.47 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  31.84 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 359 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  29.1 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  31.13 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  30.91 
 
 		 358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  45.1 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 666 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 382 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  27.9 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  26.89 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.84 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  27.52 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  26.82 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  32.12 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.92 
 
 		 466 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  25.4 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.18 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  32.8 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.68 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  25.38 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  26.23 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  25.06 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>