More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3774 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
372 aa  718    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  67.67 
 
 
364 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  65.85 
 
 
359 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  62.02 
 
 
357 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  65.48 
 
 
358 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  55.67 
 
 
397 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  52.59 
 
 
405 aa  329  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  55.65 
 
 
666 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
386 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
374 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
381 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
377 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
396 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  37.95 
 
 
374 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
379 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
381 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
382 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  30.56 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
381 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
388 aa  96.3  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  24.59 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  39.6 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  29.2 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
441 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  41.96 
 
 
800 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  38.55 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 
452 aa  66.2  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.8 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.01 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
351 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  39.49 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  37.8 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  37.59 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.73 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  37.41 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 
380 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 
396 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 
418 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.47 
 
 
401 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
467 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
419 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
750 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  35.52 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  33.33 
 
 
392 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  35.96 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  26.48 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
435 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  38.41 
 
 
450 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  22.26 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
482 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  25.4 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
425 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
396 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>