More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1104 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  90.66 
 
 		 395 aa  739    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 396 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  46.98 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  39.11 
 
 		 378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  45.67 
 
 		 386 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 		 374 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  44.27 
 
 		 375 aa  292  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  32.01 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  34.76 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  36.49 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  35.04 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  34.22 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  32.88 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 666 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 780 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  32.84 
 
 		 650 aa  86.3  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  26.26 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  34.25 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  25.75 
 
 		 797 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.21 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  38.16 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4575  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161634  normal  0.819576 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 759 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  30.9 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  31.22 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.26 
 
 		 935 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.24 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 761 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  35.19 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.16 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>